臺北市立南門國民中學：核定總班級數 53 班〈包括普通班 42 班、特殊班 7 班、體育班 3 班、學習資源班 1 班〉。

本校各單位職掌如下：

• 校長室綜理校務。
• 教務處辦理課程教學、學籍管理、實驗研究與教學設備等業務。
• 學生事務處辦理學生活動、生活輔導、生活教育、衛生保健及體育活動業務。
• 總務處辦理公物維修、校舍及財產、公文檔案管理、環境綠美化、採購、工程修繕業務。
• 輔導室辦理學生學習及生涯發展輔導、特殊教育業務。
• 會計室辦理相關會計業務。
• 人事室辦理人事管理業務。